Jenin es una ciudad situada en el borde de una llanura conocida por los locales como Marj Ibn Amer y se mencionó en la Biblia como el valle de Jezreel o la llanura de Esdrelón. Jenin moderna es una ciudad pintoresca, rodeada de árboles de olivas y almendras. Sus fértiles terrenos de entorno eran un lugar perfecto para poblarse desde los tiempos cananeos, cuando fue llamada En ganim significando ‘la fuente de jardines. «La ciudad también se menciona en muchos escritos históricos, como los registros egipcios, babilonios y romanos.
Jenin jugó un papel importante en el pasado como la ciudad en el cruce entre el mar y las regiones del norte y el este del país. La ruta histórica Vía Maris pasaba por esta zona, así como otras rutas internas que conectan las montañas a la costa. La tradición local afirma que Jenín o Ginaea, como era conocida en la época romana, se cruzó por Cristo en varias ocasiones. Se construyó una iglesia allí durante el siglo 6 DC. Sus restos han sido descubiertos cerca de la actual Gran Mezquita.
Durante la época de los cruzados, Jenín era una pequeña pero importante pueblo. En 1187, Jenin fue conquistada por Salah Ad-Din. Más tarde, en el siglo 13, se conviertó en una ciudad importante, porque los mamelucos por temor a las invasiones de los cruzados, destruyeron las ciudades costeras y fortificaron varias ciudades del interior, incluyendo Jenin. El príncipe mameluco Tajar Al Dawadar construyó una posada, un sabil (fuente de agua) y varios baños públicos allí.